第一部分 基本的结构原则
第1章 建筑构件
蛋白质是多肽链
遗传密码规定了20种氨基酸的侧链
半胧氨酸可形成二流键
肽单元是蛋白质结构的建筑构件
甘氨酸可以适应许多不同的构象
某些侧链构象是能量有利的
许多蛋白质含固有的金属原子
结论
第2章 蛋白质结构的模体
蛋白质的内部是疏水的
α螺旋是一种重要的二级结构元件
α螺旋是一个偶极矩
β片层通常含有平行或反平行的β折叠链
环区位于蛋白质分子的表面
蛋白质的立体结构图突出二级结构
拜年图对蛋白质结构的分类有用
二级结构元件被连接，形成简单的模体
发夹β模体经常出现在蛋白质结构中
β-α-β模体含有两股平行β折叠链
蛋白质分子被组织在一定的层次结构中
大的多肽链被折叠到几个结构域中
结构域由结构模体构成
一些简单的模体组合形成复杂的模体
蛋白质结构可以分为三种主要的类型
结论
第3章 α结构域的结构
卷曲之卷曲的α螺旋含有重复的七氨基酸序列模式
四螺旋捆是α类型蛋白质中常见的域结构
α螺旋结构域有时大而复杂
珠蛋白折叠模式出现在肌红蛋白和血红蛋白中
几何因素决定α螺旋的排列
一段α螺旋的脊与邻近螺旋的沟相配
珠蛋白折叠模式在进化过程中被保留下来
疏水的内部被保留
螺旋的运动适应内部侧链的突变
镰状细胞血红蛋白产生对疟疾的抗性
结论
第4章 α/β结构域的结构
第5章 β结构
第6章 折叠和柔性
第7章 dna的结构
第二部分 结构、功能和工程
第8章 原核生物通过螺旋-转角-螺旋模体的dna识别
第9章 真核生物转录因子对dna的识别
第10章 专一转录因子属于几个家族
第11章 酶催化的一个例子：丝氨酸蛋白酶
第12章 膜蛋白
第13章 信号转导
第14章 纤维状蛋白质
第15章 免疫系统对外来分子的识别
第16章 球状病毒的结构
第17章 蛋白质结构的预测
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